Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CDH18Q13634 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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