Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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