Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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