Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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