Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms