Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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