Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CBX3Q13185 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
CBX3Q13185 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CBX3Q13185 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CBX3Q13185 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
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CBX3Q13185 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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