Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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