Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms