Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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