Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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