Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PTPRDP23468 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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