Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms