Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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