Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms