Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms