Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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