Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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