Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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