Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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