Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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DDB1Q16531 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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DDB1Q16531 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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DDB1Q16531 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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