Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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