Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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