Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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