| RUNX2 | Q13950 | AL138916.1-201 | ENST00000436295 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117341.1-201 | ENST00000437213 | 373 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP7-201 | ENST00000439968 | 331 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z82210.1-201 | ENST00000440037 | 231 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIGFP3-201 | ENST00000441918 | 722 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRDX3P3-201 | ENST00000447765 | 522 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073415.1-201 | ENST00000449240 | 153 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL392046.1-203 | ENST00000450106 | 651 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000431.2-201 | ENST00000450653 | 790 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL118520.1-201 | ENST00000450770 | 291 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP23-201 | ENST00000452014 | 332 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-182P-201 | ENST00000459009 | 62 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-63P-201 | ENST00000459054 | 62 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GMFBP1-201 | ENST00000467831 | 427 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCH1-AS2-201 | ENST00000472913 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TIPARP-AS1-202 | ENST00000478005 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012181.1-201 | ENST00000479895 | 423 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117522.3-201 | ENST00000507974 | 584 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02174-201 | ENST00000508977 | 553 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-685P-201 | ENST00000517088 | 95 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF117829.1-204 | ENST00000519854 | 284 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006518.2-202 | ENST00000544947 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078778.1-201 | ENST00000547177 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AMZ2P1-203 | ENST00000565833 | 850 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092325.1-201 | ENST00000566449 | 554 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093515.1-201 | ENST00000567103 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC174048.1-201 | ENST00000603389 | 144 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008962.1-201 | ENST00000605729 | 304 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356321.1-201 | ENST00000621360 | 228 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VPS8-228 | ENST00000628962 | 207 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | hsa-mir-4776-1.1-201 | ENST00000636364 | 80 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP3S1-209 | ENST00000640413 | 489 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103710.2-202 | ENST00000641454 | 2853 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUC15-205 | ENST00000529533 | 2084 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF83-201 | ENST00000301096 | 2599 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1283P-201 | ENST00000365314 | 105 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AKR1C1-201 | ENST00000380859 | 858 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA69-201 | ENST00000383895 | 132 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.402-201 | ENST00000383972 | 102 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ17-201 | ENST00000390520 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTMAP5-201 | ENST00000393073 | 333 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS12P24-201 | ENST00000412619 | 387 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP8-201 | ENST00000422855 | 651 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC017074.1-201 | ENST00000424612 | 561 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C1orf195-201 | ENST00000424792 | 255 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO1P20-201 | ENST00000425366 | 358 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00844-201 | ENST00000432535 | 477 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC000111.3-201 | ENST00000433478 | 193 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092573.2-201 | ENST00000434546 | 243 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354936.1-201 | ENST00000441521 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357552.1-201 | ENST00000445254 | 415 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00395-202 | ENST00000451570 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01038-201 | ENST00000457858 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01510-203 | ENST00000458082 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM92A1P2-202 | ENST00000504766 | 877 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APOOP4-201 | ENST00000513530 | 597 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-123P-201 | ENST00000516163 | 102 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.689-201 | ENST00000516589 | 107 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV2-26-201 | ENST00000518305 | 343 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109635.3-201 | ENST00000529536 | 185 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007458.1-201 | ENST00000542812 | 373 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR383656.11-201 | ENST00000552261 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4703-201 | ENST00000577728 | 79 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC003687.1-201 | ENST00000578040 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098826.3-201 | ENST00000603823 | 466 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161798.1-201 | ENST00000604630 | 131 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P7-201 | ENST00000604681 | 321 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.45-201 | ENST00000607547 | 219 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XIST_intron.1-201 | ENST00000619444 | 68 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010338.1-201 | ENST00000621823 | 717 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U6.98-201 | ENST00000637157 | 84 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CADM2-AS1-201 | ENST00000476021 | 2656 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NXPE1-204 | ENST00000536271 | 2289 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPP1R12A-204 | ENST00000546369 | 2977 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRRG1-202 | ENST00000449135 | 4481 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIAA0586-209 | ENST00000556134 | 5912 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAS2R14-202 | ENST00000537503 | 1858 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SYTL2-203 | ENST00000359152 | 4123 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2L2-201 | ENST00000254302 | 429 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.38-201 | ENST00000362617 | 102 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1167P-201 | ENST00000363227 | 94 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-534P-201 | ENST00000364877 | 106 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-996P-201 | ENST00000365438 | 107 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00862-202 | ENST00000367356 | 759 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK8-202 | ENST00000374174 | 739 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-190P-201 | ENST00000384154 | 102 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.534-201 | ENST00000384599 | 112 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR490-201 | ENST00000384865 | 128 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC16P-201 | ENST00000408591 | 138 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158071.1-201 | ENST00000430315 | 461 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01626-201 | ENST00000431997 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004691.1-201 | ENST00000440376 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RBMX2P4-201 | ENST00000441256 | 376 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-261P-201 | ENST00000459506 | 102 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC046136.1-201 | ENST00000459855 | 533 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP14-201 | ENST00000468281 | 468 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092989.1-201 | ENST00000481235 | 277 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P25-201 | ENST00000481709 | 171 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160314.1-201 | ENST00000490836 | 438 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |