Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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