Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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