Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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