Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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