Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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