Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms