Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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FOXF1Q12946 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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