Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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