Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFFO1Q0D2I5 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms