Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms