Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00587B1AMM8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00587B1AMM8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms