Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXC10Q9NYD6 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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HOXC10Q9NYD6 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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HOXC10Q9NYD6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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