Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERGIC2Q96RQ1 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERGIC2Q96RQ1 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms