Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms