Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
FOXD1Q16676 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms