Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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