Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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