Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SEC23BQ15437 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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