Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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