Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms