Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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