Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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