Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms