Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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