Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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